Il tappo ventilato contiene una membrana idrofobica che consente un libero scambio gassoso pur mantenendo la sterilità ed è adatto agli ambienti standard degli incubatori a CO₂. Il tappo sigillato è adatto a condizioni particolari, come il trasporto e la coltura in ambienti a basso contenuto di ossigeno, per prevenire la contaminazione e la fuoriuscita di liquidi. Per la maggior parte degli esperimenti si consiglia di utilizzare una bottiglia per coltura con tappo ventilato, in combinazione con una pellicola sigillante per bottiglie di coltura o un ambiente di lavoro sterile.